Identification et quantification des biomarqueurs moléculaires
Chromatographe en phase gazeuse (Trace 1300) équippé d'un passeur automatique (AS 3000) et couplé à un spectromètre de masse simple quadripole (ISQ QD)
Description de l’instrument :
Passeur automatique (AS 3000) : Le passeur automatique prélève au moyen d'une seringue quelques µL de la fraction en solution dans un solvant organique et l'introduit dans l'injecteur du chromatographe en phase gazeuse. Il dispose de 105 positions pour héberger des flacons, ce qui lui confère une large autonomie.
Chromatographe en phase gazeuse (Trace 1300) : Lorsque la solution est introduite dans l'injecteur, les biomarqueurs moléculaires seront focalisés en tête de colonne capillaire par effet de point froid, la température de l'injecteur étant définie à 280 °C alors que le four deu chromatographe est à 50 ou 80 °C en début d'analyse. Les biomarqueurs moléculaires sont progressivement séparés dans la colonne capillaire sous flux d'hélium, lors de la montée en température du four de chromatographie (jusqu'à 300 °C en général), en fonction de leur masse moléculaire et de leur polarité.
Spectromètre de masse (ISQ QD) : Lorsque les biomarqueurs moléculaires parviennent en fin de colonne dans le spectromètre de masse ils y sont ionisés et fragmentés par impact électronique. Le spectromètre de masse déterminera la masse de chaque fragment ainsi que son abondance.
Analyses réalisées sur l’instrument :
Le résultat obtenu est sous la forme d'un chromatogramme qui reflètre l'évolution de l'abondance des fragments de molécules au cours de l'analyse et, pour chaque point d'analyse, un spectre de masse qui correspond à l'abondance des fragments de différentes masse, véritable fiche d'identité des biomarqueurs. Il reste alors à quantifier chaque biomarqueur, à l'identifier grâce à des bases de données ou à la littérature, puis à en déterminer l'origine et la signification.
Contacts :
Caroline Gauthier : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Emmanuelle Casanova : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Jérémy Jacob : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Analyse isotopique (δ13C) et élémentaire (C, N) de la matière organique
Spectromètre de masse isotopique (ThemoScientific Delta + XP) couplé à un analyseur élémentaire (FlashEA 1112 Series)
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Description de l'instrument :
Spectromètre de masse à rapport isotopique (IRMS) Delta Plus XP (ThermoFinnigan), installé au LSCE en 2001, couplé à un analyseur élémentaire Flash EA 1112 Series installé en 2008. Ce spectromètre est de type à flux continu. Il est dédié à l'analyse de la matière organique contenue dans différents types d'échantillons (sédiments, os, tissus, particules en suspension, etc.). La précision de mesure des isotopes du carbone est d'environ 0,05 ‰. La quantité de carbone nécessaire pour une mesure est de 20 à 40 μg pour les mesures isotopiques et une quantité de 10 à 15 mg d'échantillons est nécessaire pour l'analyse élémentaire.
Principe de l'analyse :
https://fr.wikipedia.org/wiki/Spectrom%C3%A9trie_de_masse_%C3%A0_rapport_isotopique
Measurements performed by instrumentation:
δ13C, δ15N sur matière organique (sédiment, lœss, sol, POC sur filtre, tissus, collagène, ….)
Incertitude analytique
s= 0.2 à 0.1‰ pour le δ13C de matière organique bulk selon le nombre d’aliquotes
s= 0.3 à 0.2‰ pour le δ15N de matière organique bulk selon le nombre d’aliquotes
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